Temporada Especial
Despertar de X.A.N.A. Parte 1 (O super-computador é ligado, Jeremy fala com Aelita(chamada Maya na altura), Odd e Ulrich virtualizados em Lyoko pela 1ª vez, novos monstros: Kankralat, Hornet, Block; novos sectores: Floresta, Gelo)
Despertar de X.A.N.A. Parte 2 (Yumi é virtualizada em Lyoko pela 1ª vez, novos monstros: Krabe; novos sectores: Montanha, descoberta do programa de Regresso ao Passado, descoberta de X.A.N.A e a neutraliza-lo)
Primeira Temporada
1 - Teddygozila (Novos monstros: Megatank; novo sector: Deserto)
2 - É Ver para Crer
3 - Férias Assombradas
4 - O Diário
5 - O Poderoso Vírus
6 - Dilema Cruel
7 - Um Problema de Imagem
8 - Fim de Cena
9 - O Satélite
10 - A Menina dos Meus Sonhos
11 - Infestação
12 - Ataque de Vespas
13 - Bem a Tempo
14 - A Armadilha
15 - Ataque de Risos
16 - Claustrofobia
17 - Amnésia
18 - Música Mortífera
19 - A Fronteira
20 - Os Robôs
21 - Zona de Gravidade Zero
22 - Rotina
23 - Bater Fundo?
24 - Canal Fantasma
25 - Código:Terra (Aelita é materializada para o mundo real. Jim junta-se ao grupo temporariamente pois é ferido e Jeremy é obrigado a regressar ao passado. )
26 - Começo Falso
Segunda Temporada
27 - Nova Ordem (Novos monstros: Tarantula; Descoberta do programa dos veiculos)
28 - Território Inexplorado (Descoberta do Setor 5; Novos monstros: Scyphozoa, Creeper)
29 - Á Descoberta (Novos monstros: Manta)
30 - Um Grande Dia
31 - Senhor Puck
32 - Dia de São Valentin
33 - Mistura Final
34 - O Elo Perdido
35 - Amigos em Apuros
36 - Marabunta
37 - Interesses em Comum
38 - Tentação
39 - Direção Ruim
40 - Ataque de Zumbis
41 - Ultimatum
42 - Que Confusão
43 - O Beijo de X.A.N.A.
44 - Vertigens
45 - Guerra Fria
46 - Déjà Vu
47 - Em Excelente Forma
48 - Alguém está aí?
49 - Franz Hopper
50 - Contato
51 - Revelações
52 - A Chave
Terceira Temporada
53 - Direto ao Coração (Descoberta do coração de Lyoko, Aelita recebe novos poderes Energy Field e não necessita do Code Earth para ser materializada)
54 - Um Lyoko a Menos (Ocorre a destruição da região da floresta)
55 - Onda Fatal
56 - Falso Líder
57 - Aelita
58 - O Pretendente (Ocorre a destruição da região do deserto)
59 - O Segredo
60 - Insanidade Temporária
61 - Sabotagem (Ocorre a destruição da região do gelo)
62 - Ninguém em Particular
63 - sarilhos triplos!
64 - Problemas à Dobrar (Ocorre a destruição da região das montanhas; descoberta do programa de virtualização directa no Sector 5; William junta-se a grupo)
65 - A Batalha Final (X.A.N.A possui William; ocorre a destruição de Lyoko)
[editar] Quarta Temporada
66 - O Regresso de William
67 - Réplica (Novos equipamentos e descobriu-se uma réplica de Lyoko)
68 - Ato de Abertura
69 - Sala da Destruição
70 - Skidbladnir (Construção do Skidbladnir)
71 - Primeira Viagem (Novos monstros: Kongers)
72 - Curso intensivo
73 - Réplica (Nova réplica: Setor da Floresta)
74 - Eu prefiro não falar sobre isso
75 - Chuva Quente
76 - O Lago
77 - Perdidos no Mar
78 - Experiência
79 - Aracnofobia (A réplica da região da floresta, localizada na Floresta Amazônica, é destruida)
80 - Tarde de Cachorro
81 - Falta de Boa Vontade (Novos monstros:Sharks)
82 - Memória Distante
83 - Má Sorte (Nova réplica: Região do Deserto; a réplica da região do deserto é destruida)
84 - Míssil Guiado
85 - A Bela de Kadic
86 - enigma canino
87 - Planeta Azul (Nova réplica: Setor 5; a réplica do Setor 5, localizada no espaço, é destruida)
88 - Primos Inimigos
89 - Música que Acalma a Besta Selvagem
90 - Medusa
91 - Má conexão
92 - Suando Frio (Nova réplica: Região de Gelo; novos monstros: Kolossus)
93 - Debaixo da Terra (William é libertado de X.A.N.A, e skid é destruido)
94 - Lutar até o fim (Todas as centenas de réplicas restantes são destruídas, ocorre a morte de X.A.N.A e de Franz Hoper)
95 - Ecos (Ocorre o Desligamento do Supercomputador)
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